1949年1月，王冠亚投身中国人民解放军，在阜阳军分区文工队、安徽军区文工团以及南京军区前线歌舞团中展现了其才华。1956年5月，他转业至安徽省黄梅戏剧团，并担任表演、导演、编剧和创作组副组长等职务，同时还曾担任二团艺委会主任直至1989年11月的退休。在学术领域，王冠亚在1950年毕业于安徽师范大学数学系本科，并在1965年结业于上海戏剧学院戏曲导演干部进修班。

在他的职业生涯中，“红楼梦”、“西厢记”等黄梅戏舞台剧均由他精心导演。此后，他又致力于创作改编电视连续剧，如《西厢记》、《貂蝉》、《桃花扇》，共计17部70集作品，这些作品多次获得大众电视“金鹰奖”、“飞天奖”，甚至还荣获美国南海金猴奖。此外，他还创作并导演了黄梅戏舞台剧《孟姜女》，并将其改编为电影，再次凭借此片参加新加坡第二届中国电影节。