1949年1月，王冠亚投身中国人民解放军，在阜阳军分区文工队、安徽军区文工团以及南京军区前线歌舞团中展现了其才华。1956年5月，他转业至安徽省黄梅戏剧团，担任表演、导演、编剧和创作组副组长，并曾任二团艺委会主任直至1989年11月的离休。学术方面，他在1950年毕业于安徽师范大学（原国立安徽大学）的数学系，并在1965年结业于上海戏剧学院戏曲导演干部进修班。

此前的他曾执导多部黄梅戏舞台剧，如《红楼梦》、《西厢记》，这些作品深受观众喜爱。此后，王冠亚继续其艺术探索，对电视连续剧进行了创新创作。他总共创作改编了17部70集电视连续剧，其中包括《西厢记》、《貂蝉》、《桃花扇》，这些作品赢得了大众电视“金鹰奖”、“飞天奖”，以及美国南海金猴奖的殊荣。此外，他还成功地将黄梅戏带入电影领域，以电影《孟姜女》的形式呈现。更值得一提的是，王冠亚参与新加坡第二届中国电影节，为他的事业增添了一份国际认可。