1、民族服饰各异，回族的传统装束源自阿拉伯文化，其特点是头戴白布巾（称为戴斯塔尔），垂至后脑勺；身着长衫，夏季以白色为主，冬季则更换成黑色。相比之下，维吾尔族女性常穿火红色的裙子，而男性则佩戴绣花图案的上衣，并且他们的帽式与回族有所区别。

2、语言差异显著，维吾尔语属于阿勒泰语系突厥语族，与回族使用汉语不同。部分情况下，回族会使用阿拉伯语作为宗教用语。而维吾尔人在宗教领域，则更多地采用波斯语进行交流。

3、两个民族在外观上存在明显差异。维吾尔人体貌如同欧洲人的风格，而回族人的面容则更接近于汉人的特征。

4、尽管双方都信仰伊斯兰教，但它们在多个方面仍有所区别。在历史上，为区分内地的穆斯林与新疆地区的維吾爾人，一般将新疆維吾爾人和来华的阿拉伯或波斯穆斯林称作“缠头”，即那些头部缠着头巾的人。而对于内地信奉伊斯兰教的人来说，他们通常被归类为“汉回”，这意味着这些“汉回”既信仰了伊斯兰教，又保持了自己的汉姓和文化习俗。

5、关于两者的起源，一种说法认为维吾尔人的祖先是铁勒部与突厥联合而成，这使得他们成为一支具有悠久历史的突厥民族，从南俄草原到中亚，再至中国北方，他们留下的足迹无处不在。在当时，被拜旦庭历史学家记载为阿瓦尔人的柔然，即被认为是蒙古人种的一部分，也就是黄种人。而另一方面，随着成吉思汗的大军进攻，他吸纳了一大批来自中亚和西域（包括现在的大量阿拉伯地区）的士兵，这些士兵之后定居于宁夏甘肃一带，被称作最早期的一批穆斯林居民。这群人口由来已久，以及日后的更多融合，使得现代社会中的这一区域形成了复杂多样的文化交融现象。