在脱烈哥那摄政期间，他结党营私，排除异己，将一批不学无术的人任命为朝廷内的官员。法提玛，本是波斯人，被俘后不务正业，却常接近脱烈哥那哈敦的斡尔朵。因此，当脱烈哥那掌权时，他权势熏天，有一次甚至与脱烈哥那合谋逮捕了中书右丞相田镇海和燕京行台断事官牙老瓦赤。田镇海、牙老瓦赤得知后逃奔到阔端斡尔朵，寻求庇护。在这段时间里，中书令耶律楚材含怨而死。大商人奥都剌合蛮被派往中原，接替牙老瓦赤的职务。

脱烈哥那的摄政导致成吉思汗《札撒》遭废弃，使法度不一。诸王各自派使臣四处滥发诏旨牌符，结党为非，这些行为几乎让蒙古帝国走向崩溃边缘。在窝阔台汗在位时，他指定阔出的儿子失烈门为继承人，但窝阔台去世后，脱烈哥那违背其生前意愿，决心立自己的儿子贵由为汗。

1246年七月，一次大会召开，以推举新大汗，但就在拔都和宗亲们还未到达之前，脱烈哥那和他的支持者就以他们的力量将贵由立为大汗。这标志着“黄金家族”内部纷争的开始。实际上，由于贵由自幼多病，不适宜处理国家大事，因此朝政多出于脱烈哥那主张，而真正处理政务的是右丞相田镇海和断事官哈达。不过，这也埋下了贵由即位后的种种问题，为未来蒙古帝国带来了更多挑战。