1949年1月，王冠亚投身中国人民解放军，在阜阳军分区文工队、安徽军区文工团以及南京军区前线歌舞团中展现了他的才华。1956年5月，他转业至安徽省黄梅戏剧团，并担任表演、导演、编剧和创作组副组长的职务，同时还曾担任二团艺委会主任直到1989年的11月离休。在学术方面，王冠亚在1950年毕业于安徽师范大学（原国立安徽大学）的数学系，并在1965年结业于上海戏剧学院的戏曲导演干部进修班。

此前的他曾有幸执导多部黄梅戏舞台剧，如《红楼梦》、《西厢记》，这些作品都获得了高度评价。此后，王冠亚继续创作改编电视连续剧，《西厢记》、《貂蝉》、《桃花扇》等共计17部70集之巨，这些作品荣获了大众电视“金鹰奖”、“飞天奖”以及美国南海金猴奖。除了电视连续剧，他还创作并导演了一系列黄梅戏舞台剧中的经典之一——《孟姜女》，并将其改编为电影版本参赛新加坡第二届中国电影节。