蒙、元时期先后行用两种蒙古文字。一是蒙古畏兀字,一是八思巴蒙古字。它在发展民族文化,保存蒙、元时期丰富的文化遗产等方面起了重要作用。

    蒙古畏兀字创制于成吉思□时期（1206～1227）。蒙古原无文字，据《蒙鞑备录》、《黑鞑事略》等载，习用刻木记事。成吉思□建国时，以畏兀字母书写蒙古语，称为蒙古畏兀字。畏兀字即古回鹘字，源于粟特字,是一种拼音文字，创始于8世纪。原为自右向左横写,后改为自左向右竖写。共有字母二十个左右,各时期有所增损。蒙古畏兀字以畏兀字母拼写蒙古语言，亦自左向右竖写。自1206年以来,逐渐在蒙古族中行用。蒙元统治者用以书写诏令文书,并曾用以译写《孝经》、《资治通鉴》、《贞观政要》等汉文典籍。现存蒙古畏兀字文献，最早者为苏联列宁格勒所存1225年移相哥刻石（或称成吉思□石）文字五行。

    中国所藏1240年紫微宫碑蒙古畏兀字三行（《元代白话碑集录》）也是较早的一种。元朝建国以后，刊有蒙古畏兀字的碑石，现有多种留存在中国各地。北京故宫图书馆藏有元代刊刻的蒙古畏兀字与汉字对译的《孝经》，是罕见的古籍。元世祖忽必烈命八思巴制作蒙古字颁行后，蒙古畏兀字不再作为官方文字，但仍在民间行用。

    八思巴蒙古字元世祖忽必烈在1260年即位后，封授吐蕃萨斯迦□嘛八思巴为国师，命他制作蒙古字。至元六年(1269)正式颁行,称为蒙古新字,次年又改称蒙古国字。至元八年规定:“今后不得将蒙古字道作新字。”八思巴新制的蒙古字由此成为官方法定的文字。这种蒙古字系依据藏文字母改制而成。藏文字母来源于梵文字母，横行拼写。八思巴制蒙古字，改为方体，自上而下直写，自右向左行，当是参照了蒙古畏兀字和汉字的书写及构字方式。

    八思巴蒙古字共有字母四十多个，用以拼写蒙语，也拼写汉语。字母基本通用，但有些字母在拼写蒙语和汉语时，代表的音值不同。现存八思巴蒙古字文献，主要是保留在中国各地的碑石和历代收藏的拓本，以及官印、钱钞等文物上。广东南华寺保存的元仁宗爱育黎拔力八达圣旨原件，是现存元代八思巴蒙古字的珍贵文献。《事林广记□蒙古字百家姓》和传写本《蒙古字韵》将汉字与拼写汉语的八思巴蒙古字对照，是当时的识字课本。

    此外，现在还可见到八思巴蒙古字拼写藏语的佛经残片。至元六年元世祖颁行新字的诏书，曾明确规定，以新制的蒙古字“译写一切文字”，实际上是企图以一种通用字母拼写蒙、汉、藏等各民族的语言。这是中国文字史上的一次创造性的尝试，也是制作汉语拼音字的第一次尝试。但由于同时兼顾几个民族的语言，在表示音值和构制字体时都不免存在各种缺陷。

    采用汉字方体字形拼写蒙语，以一个方体字拼写一个音缀，致使语词割裂，不易识读，不如蒙古畏兀字以词为单位构字，便于读写。八思巴字百家姓《事林广记》卷五/续集十二下元朝一代,八思巴蒙古字始终作为官方文字行用。元朝亡后，北元也还用以铸造官印。此后，八思巴蒙古字渐不通用。蒙古畏兀字经过改革，沿用至今。