1949年1月，王冠亚加入中国人民解放军，在阜阳军分区文工队、安徽军区文工团以及南京军区前线歌舞团担任文艺工作。1956年5月，他转业至安徽省黄梅戏剧团，担任表演、导演、编剧和创作组副组长，并曾任二团艺委会主任直至1989年11月离休。在学术方面，王冠亚在1950年从安徽师范大学（原国立安徽大学）的数学系毕业，并于1965年在上海戏剧学院的戏曲导演干部进修班结业。

此前，他曾执导黄梅戏舞台剧《红楼梦》、《西厢记》等作品。此后，又致力于创作改编电视连续剧，如《西厢记》、《貂蝉》、《桃花扇》，共计17部70集电视连续剧，其中多次获得大众电视“金鹰奖”、“飞天奖”，以及美国南海金猴奖。此外，还创作并导演了黄梅戏舞台剧《孟姜女》，并制作了电影版的《孟姜女》，还参与了新加坡第二届中国电影节。