1949年1月，王冠亚加入了中国人民解放军，并在阜阳军分区文工队、安徽军区文工团以及南京军区前线歌舞团中担任文艺工作。1956年5月，他转业至安徽省黄梅戏剧团，在那里他担任表演、导演、编剧和创作组副组长，以及二团艺委会主任等职位，直到1989年11月离休。在学术方面，他先是在1950年毕业于安徽师范大学（原国立安徽大学）的数学系，本科班，然后在1965年结业于上海戏剧学院的戏曲导演干部进修班。

此前，王冠亚曾负责指导多部黄梅戏舞台剧，如《红楼梦》、《西厢记》，并取得了显著成就。此后，他又创作并改编了电视连续剧《西厢记》、《貂蝉》、《桃花扇》等17部70集作品，这些作品不仅获得了大众电视“金鹰奖”和“飞天奖”，还赢得了美国南海金猴奖。他同时也创作并导演了一系列黄梅戏舞台剧，其中包括《孟姜女》，并且参与制作了一部以同名故事为基础的电影版本。此外，他还参加了新加坡第二届中国电影节。